十三勇士入玉门这个故事是东汉时期耿恭的故事，当时的东汉刚刚经历了西汉末年的战乱，经过三十年的发展，国家稳定下来，生产发展，国力恢复，为了加强对西部地区的管理，东汉派出军队西征匈奴，打垮了匈奴的残余力量，恢复了对西域的掌控。

为了有效管辖这块富庶的土地，恢复了西域都护府，东汉朝廷派出戊己校尉耿恭，镇守西域。这时候打击匈奴的汉朝军队主力已经撤离了西域，只留下了三千兵分布在西域的几个战略要点进行布防。

在东汉出兵攻打之前，这块地方是在匈奴的掌控之下，匈奴的统治十分残酷，每年要从这里的人民身上榨取很多牛羊、粮食和战马，充实匈奴的实力，导致当地百姓的反抗，但是又打不过匈奴。

于是早在公元45年西域诸国就派使者带着王子到达洛阳，求请汉朝接受他们的王子为人质，恢复西域都护府的建制，但是当时的东汉政权刚刚建立，无力恢复西域都护府，于是婉拒了西域诸国的请求。

28年后，东汉的国力得到了充实，才能派出军队击溃匈奴，恢复西域原有的统治秩序。

在这样的历史背景下，匈奴是不甘心失败的，他们要继续实现自己在西域的利益，于是匈奴在汉军主力撤离西域后，出兵攻打臣服东汉的车师国，杀了车师国王，随即出兵包围了金蒲城。

虽然当时耿恭手下只有几百士兵，但是耿恭和战士们对这些来犯之敌根本不在乎，一边精心组织防御，一面派出范羌到酒泉去求救兵。

中国自古以来对军队的调动有着一套严格的管理制度，有虎符制度，到了东汉时期，需要圣旨，没有皇帝的圣旨是不能调动一兵一卒的。无奈之下，范羌只能回洛阳求救。

这时候的金蒲城就很危急了，匈奴围城日久，粮草断绝，耿恭和手下将士只能煮弓弦和铠甲充饥。耿恭让战士在箭头上抹上毒药，然后耿恭对着匈奴军队大喊，让你们看看汉家神箭的妙处。

于是乱箭射向匈奴，匈奴发现中箭后伤口不愈合，以为是什么神奇的武器，军心动摇。恰在此时天降大雨，匈奴以为是上天护佑耿恭，于是就撤围而去。

两个月后，匈奴再次攻打疏勒城，耿恭率领手下士兵据守此城。本来城外有条河，河水流进城里，但是匈奴把水源切断了，耿恭令士兵打井，井打到15丈深还不见水，已经开始有人从马粪中榨水喝了。

耿恭向天祈祷，然后带领全体士兵向这口井膜拜，结果水井中涌出泉水。耿恭令士兵把水向城外泼，匈奴看耿恭有水直到围困没用，于是就撤了。后来耿恭拜井成了中国象棋中的一个定式。

不巧的是，这个时候汉明帝死了，朝廷里头都忙着给老皇帝办丧事，给新皇帝办登基，忙的一塌糊涂，所以范羌到达洛阳以后虽然报告了前方的紧急军情，但是，啥事儿也没有皇帝权力交接重要。

再说，对于偌大的汉朝来说耿恭和西域都不算什么，人死了可以再派，地丢了可以再夺回来，所以救兵直到柳中城的守将关宠求救的奏折摆到新皇帝——汉章帝面前，才被派出来。

这时候的耿恭还在苦苦坚守城池，匈奴派人劝降，耿恭把这个人骗进城里杀掉烤着吃了，当时的城内已经没有粮草了，耿恭手下的士兵也越来越少了。

汉朝派出的救兵先打了车师国，大获全胜，车师国再次臣服，因为车师国被匈奴打败后背叛汉朝了。这时候汉朝大军就要班师了，结果范羌要求去救耿恭，得到了两千士兵，于是范羌率领着两千人不辞劳苦——从深达一丈的雪地跋涉而过。

耿恭听到马蹄声以为是匈奴军队，结果是汉军，于是立即振奋精神带着手下仅剩的26人接应范羌，打败了匈奴。而这些人跟着救兵返回玉门关时仅剩13人了，所以叫十三勇士入玉门。